Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PATL2C9JE40 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms