Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRCP1A6NGW2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms