Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB5A4FU69 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms