Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms