Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms