Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTC7AQ9ULT0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms