Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms