Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF11Q9UIL8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms