Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLKQ9UBE8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms