Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKIRAS1Q9NYS0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms