Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms