Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms