Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms