Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms