Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMGN5-205ENST00000447319 742 ntTSL 36.06□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMGN5-202ENST00000373250 572 ntTSL 36.06□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC6.05□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 G3BP2-215ENST00000510902 338 ntTSL 36.04□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NUP37-206ENST00000550459 645 ntTSL 36.01□□□□□ -1.452e-22■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATXN7-209ENST00000484668 573 ntTSL 36.01□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF3-205ENST00000468466 514 ntTSL 46.01□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.459e-9■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DTL-204ENST00000489149 815 ntTSL 25.99□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SECISBP2L-211ENST00000561428 398 ntTSL 35.99□□□□□ -1.459e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SLCO2B1-206ENST00000525845 274 ntTSL 1 (best)5.98□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SLC9B1-209ENST00000512651 406 ntTSL 55.94□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DDX18-205ENST00000476149 5674 ntTSL 25.9□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NUP37-202ENST00000543021 784 ntTSL 25.89□□□□□ -1.472e-22■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TANC2-205ENST00000580466 331 ntTSL 35.85□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.489e-9■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PDE11A-211ENST00000497003 3000 ntTSL 1 (best)5.78□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-AS1-222ENST00000425333 546 ntTSL 45.76□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-220ENST00000635669 569 ntTSL 45.73□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF3-209ENST00000477833 757 ntTSL 35.71□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 APOO-208ENST00000634086 461 ntTSL 35.68□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC66-204ENST00000422222 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.62□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.519e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNX14-213ENST00000508980 3615 ntTSL 25.61□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC013652.1-203ENST00000560484 550 ntTSL 45.57□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DDX18-202ENST00000415038 644 ntTSL 55.48□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DAPK1-214ENST00000494010 696 ntTSL 35.47□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SSBP2-210ENST00000508912 256 ntTSL 25.42□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.558e-7■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 THUMPD3-AS1-218ENST00000522525 1867 ntTSL 1 (best)5.36□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMBIM6-215ENST00000548894 373 ntTSL 45.32□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 THAP12-204ENST00000529901 6795 ntTSL 1 (best)5.31□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BAZ2B-212ENST00000482503 1670 ntTSL 55.31□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C7orf31-204ENST00000443822 555 ntTSL 45.29□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TERF2-202ENST00000564982 573 ntTSL 35.28□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BECN1-204ENST00000585515 636 ntTSL 25.28□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-AS1-254ENST00000599673 665 ntTSL 55.26□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MSL2-204ENST00000481989 576 ntTSL 45.25□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJA3-205ENST00000572009 331 ntTSL 55.17□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.14□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SREK1IP1-203ENST00000510616 392 ntTSL 25.09□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AL365259.1-202ENST00000427852 475 ntTSL 34.99□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNX14-207ENST00000503491 3491 ntTSL 24.93□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NUP155-204ENST00000507233 459 ntTSL 44.92□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PAH-217ENST00000635500 189 ntTSL 34.9□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MEIS1-205ENST00000437869 363 ntTSL 54.81□□□□□ -1.649e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ABCA17P-207ENST00000640929 328 ntTSL 1 (best)4.81□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GRIN2B-208ENST00000637214 139 ntTSL 54.75□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATP8B4-208ENST00000558906 4179 ntTSL 1 (best)4.74□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 54.72□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF3-210ENST00000481422 567 ntTSL 44.68□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WDR44-204ENST00000371848 2844 ntTSL 1 (best)4.57□□□□□ -1.689e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC005537.1-209ENST00000631050 427 ntTSL 54.55□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 34.52□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AL356599.1-201ENST00000629681 268 ntTSL 54.4□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LDLRAP1-202ENST00000462394 369 ntTSL 24.38□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZGRF1-204ENST00000445413 3089 ntTSL 1 (best)4.38□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C1orf61-224ENST00000497824 725 ntTSL 1 (best)4.36□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATP8B4-203ENST00000558024 676 ntTSL 54.35□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATP8B4-202ENST00000557955 4124 ntTSL 1 (best)4.23□□□□□ -1.732e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC66-213ENST00000471681 3120 ntTSL 54.19□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.752e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZGRF1-209ENST00000506675 2279 ntTSL 24.04□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.96□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.792e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.792e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC66-202ENST00000341455 3042 ntTSL 1 (best)3.82□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.75□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 APOO-202ENST00000439528 714 ntTSL 23.7□□□□□ -1.822e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C1orf61-205ENST00000400991 473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)3.53□□□□□ -1.842e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.852e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATP11C-207ENST00000460773 2750 ntTSL 53.41□□□□□ -1.862e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NUBPL-205ENST00000549838 556 ntTSL 53.35□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CLHC1-211ENST00000466020 153 ntTSL 53.2□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.912e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.932e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.952e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 UBR4-217ENST00000497018 183 ntTSL 32.54□□□□□ -22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TCF4-264ENST00000628391 201 ntTSL 1 (best)2.35□□□□□ -2.039e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC13-211ENST00000512009 5994 ntTSL 22□□□□□ -2.092e-6■■■■■ 149.1
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