Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms