Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms