Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms