Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms