Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms