Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms