Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms