Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
YTHDF1Q9BYJ9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms