Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms