Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms