Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms