Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPIFA3Q9BQP9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms