Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms