Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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