Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms