Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms