Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG3Q96JB2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms