Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms