Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms