Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEIL2Q969S2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL2Q969S2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms