Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms