Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3BQ92485 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms