Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms