Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms