Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
P3H3Q8IVL6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
P3H3Q8IVL6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
P3H3Q8IVL6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
P3H3Q8IVL6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
P3H3Q8IVL6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H3Q8IVL6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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