Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms