Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PBRM1Q86U86 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms