Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NANOGNBQ7Z5D8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms