Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms