Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNDC1Q76NI1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms