Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HRCT1Q6UXD1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms