Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms