Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO38Q6PIJ6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms