Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RHOA-203ENST00000422781 961 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -13e-30■■■■■ 29.6
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PRPF8Q6P2Q9 DNMT1-219ENST00000589349 603 ntTSL 46.86□□□□□ -1.312e-8■■■■■ 29.6
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PRPF8Q6P2Q9 DDX41-219ENST00000629036 606 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 SAP130-204ENST00000424298 849 ntTSL 211.08□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 TTLL4-204ENST00000417196 811 ntTSL 56.24□□□□□ -1.416e-8■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 PTMA-210ENST00000467816 378 ntTSL 211.21□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 MYO1C-206ENST00000570984 901 ntTSL 513.77□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 29.5
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PRPF8Q6P2Q9 POMK-202ENST00000518991 564 ntTSL 46.71□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 29.5
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PRPF8Q6P2Q9 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 APOH-203ENST00000581797 748 ntTSL 36.2□□□□□ -1.424e-15■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.034e-15■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 APOH-204ENST00000585162 407 ntTSL 21.28□□□□□ -2.24e-15■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 NUP188-211ENST00000550219 886 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 29.5
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