Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms